Kann mir nur vorstellen, dass das Wasser von Pflanzenwurzeln in der Kapillarsperre abgezogen wird, oder die Folie leck ist. Bei mir verdunstet bei diesen Temperaturen so gut wie gar nichts. Bevor ich vergangene Woche den Teich mit Folie abgedeckt habe, konnte ich kaum 1mm Wasserpegelunterschied binnen 24 Stunden feststellen (ich sehe das bei mir am Überlaufrohr auf den mm genau).
Wenn allerdings dein Wasser sehr viel Wärmer ist, als die Luft, dann könnte ggf. schon noch ein wenig verdunsten. Aber bei 2-3 cm pro Tag würde ich mir in jedem Fall Sorgen machen und kontrollieren, was da los ist.